高山寺は、合気道の祖植芝盛平や、博物学者の南方熊楠の墓があることでも知られる、紀伊田辺の真言宗御室派の古刹。本尊は阿弥陀如来である。高山寺の名は、天明七年（1787）からといい、かつては勧修寺、願成寺などと称したという。田辺市を流れる会津川の右岸高台にあり、海抜約30mの半島状の台地先端部に拡がる境内には、縄文時代早期後半（八千年前）に遡る高山寺貝塚（一号～三号、国指定史跡）があり、ここから出土した鉢型の土器は「高山寺式土器」と名付けられ、他に石鏃、石斧、叩石、石刃などの石器や、ハイガイ、カキなどの貝類、シカ、イノシシなどの獣骨も出土している。